Дожди не прекращались, и море как бы поделилось на две части.
Предложение сложное, сложносочиненное, имеет две основы (дожди не прекращались) и (море поделилось), между частями сложносочиненного предложения наблюдаются причинно-следственные отношения: (море как бы разделилось на две части по какой причине? Потому что не прекращались дожди) Сочинительный союз служит для выражения соединительных отношений между частями сложносочиненного предложения, поэтому
ставим запятую перед союзом "и",