Филипп II вызвал Джона на суд пэров, а когда тот не явился, объявил его нарушившим вассальную присягу и объявил его лишённым ленов. В то время, как французский король брал в Нормандии замок за замком, Джон спокойно предавался удовольствиям. В 1203-1206 вся Нормандия, Анжу, Мэн и часть Аквитании были завоёваны Филиппом II. Джон делал лишь слабые или неудачные попытки спасти их.
В 1205 начался его раздор с церковью. Монахи кентерберийские выбрали на архиепископскую кафедру своего субприора, а Джон назначил туда другое лицо. Обе стороны апеллировали к Папе Иннокентию III, который в 1207 назначил архиепископом кентерберийским Стефана Лэнгтона, известного своей святой жизнью и учёностью. Джон отказался признать его, после чего Папа в 1208 наложил на Англию интердикт, а когда Джон стал конфисковывать церковные земли, в 1209 Папа отлучил его от церкви.