С сентября 1954 по май 1985 года возглавлял комбинат. Лауреат Государственной премии СССР. Лауреат премии Совета Министров СССР. Кавалер двух орденов Ленина, ордена Октябрьской Революции, ордена Красной Звезды, трех орденов Трудового Красного Знамени. Кандидат технических наук.
Под руководством В.Ф.Новокшенова построен комбинат, завод по обогащению урана, завод по производству гексафторида урана, Иркутская ТЭЦ-10.
С начала 70-х годов и до 1985 года проведена модернизация газодиффузионного завода, что позволило увеличить производительность в три раза.
Осуществлена реконструкция завода по производству сырьевого гексафторида урана, не имеющего аналогов в мире. Разработаны новые технологические процессы и оборудование по производству фтора и фтористого водорода.
В.Ф.Новокшенов перевел комбинат на 5-дневную рабочую неделю за несколько лет до того, как это было сделано по всей стране.
В эти годы для работников был построен жилой городок (в народе "новокшеновка") со всеми необходимыми объектами социально-культурного назначения, ставший одним из красивейших и удобных для проживания районов города Ангарска.
Именем первого директора комбината Виктора Федоровича Новокшенова названа одна из улиц города.