Хлорелла, в отличие от хламидомонады, не имеет жгутиков, светочувствительного глазка и сократительных вакуолей, также хлорелла размножается только бесполым путем. Для хламидомонады характерно как бесполое, так и половое размножение. Отсюда следует, что хлорелла устроена проще.