В загальному, молекули цих двох сполук є побудовані досить схоже. Мономерами і ДНК, і РНК є нуклеотиди, 3 з яких є спільні для них. В склад цих спільних нуклеотидів входять такі азотисті основи як: аденін, цитозин і гуанін. Зв’язок між нуклеотидами є фосфодиефірний як у ДНК, так і у РНК.