Размножаются хвойные семенами, которые образуется в шишках. Мужские и женские шишки образуются, как правило, на одном растении, поэтому хвойные обычно однодомные растения. Они ветроопыляемых, поэтому растут большими группами, что способствует лучшему опылению и образованию большего количества семян. Вегетативное размножение в хвойных отсутствует, только несколько видов (кипарисы) можно размножать вегетативно с помощью черенков.