Например слово ПЕНЬ
пенЕК - маленький пень. Уменьшительный суффикс -ек делает из большого пня маленький.
ДВА ПНЯ -или - К ПНЮ - окончание меняет смысл слова.
ОПЕНОК - приставка -о - показывает, что этот гриб растет около пня, у самого его корня, подножья.