Большинство учёных считают Байкал озером тектонического происхождения давностью в 25 - 35 миллионов лет тому назад, однако есть версии и о сравнительной молодости этого озера, например, гипотеза Татаринова, высказанная им в 2009 году, считающему, что глубоководной части озера около 150 000 лет, а современной береговой линии около 8 000 лет.
Байкал находится в рифтовой впадине. Одни исследователи полагают, что озеро образовалось в результате того, что находится в зоне трансформного разлома (т.е. вдоль границы литосферной плиты), другие объясняют его образование пассивным рифтингом в результате коллизии (столкновение континентальных плит) Европейской плиты и Индостана. Точно пока никто не знает.