Ну если вкратце, то сочинительные союзы разбивают сложное предложение так, что основы их не зависят друг от друга.
Например: Я сижу в инете, и сайт "ответы" опять таки тупит. Видишь, как две грамматические основы совсем не зависят друг от друга. Я сижу себе и сужу, а сайт "ответы", гад такой, тупит себе и тупит. Вот это и есть сложносочинённое предложение с сочинительным союзом "и".
А вот сложноподчинительные союзы разбивают предложение так, что основы их зависят друг от друга, и от одной основы можно задать вопрос к другой.
Например: Я сижу на сайте "ответы", который всё время страшно тупит. Чуешь разницу? ! Как две грамматические основы зависят друг от друга?
Вот в этом вся и фишка.