Ну смотря какой Линукс )
возьмем убунту.
Различия - по умолчанию в убунту панель задач сбоку, в винде - снизу.
Идем дальше.
Все уведомления - сверху в правом углу.
В винде - снизу справа.
Дальше - Различия в меню входа в систему.
В винде по центру, в убунту - немного левее.
Еще - в убунту кнопка выключения в интерфейсе сверху справа, в винде - в пуске.
Ну вот)
На примере Windows 10 и Ubuntu 14