Прежде всего в том, что автор исследует не обстоятельства преступления, а его мотивы, и доходит самых глубоких философских выводов, доказав, что идея права сильной личности может возникнуть только на неблагополучном социальном фоне, в условиях несправедливого общественного устройства, что эта идея, фашистская по своей сути, нечеловеческая. Главные вопросы, что ставит роман, - не что, не как, а почему.
В детективном романе главное - сюжет, а в "Преступлении и наказании" - беспокойно пульсирующая мысль гуманиста и философа, который ищет путь к общечеловеческой правды.