Потому что у них разные типы завязи. У вишни завязь нижняя, с одной
семяпочкой внутри. Из семяпочки развивается косточка, из стенки завязи -
сочный оклоплодник. Плод - костянка.
У малины завязь верхняя, множество семяпочек сидят на выпуклом цветоложе, из каждой семяпочки тоже развивается косточка (или орешек, плод еще называют многоорешек) с сочным околоплодником. Плод - сложная костянка.