Экологические проблемы на Амуре обострились в последние десять лет. Ежегодно, начиная с 1996 года, фиксируются загрязнения, вызванные деятельностью приграничных промышленных предприятий Китая, а также отсутствием соответствующих мер по сохранению состояния водоема с российской стороны. Авария на нефтехимическом заводе в городе Цзилинь Китайской Народной Республики в ноябре 2005 года, привела к резкому ухудшению экологической обстановки на Амуре.