В отличие от моховидных, плауновидные имеют покровные, механические и проводящие ткани. Органы крупные, споры созревают в спорангиях, собранных в колоски. Гаметофит - маленькая пластинка - заросток, а спорофит - зеленое многолетнее растение с корнем, стеблем, листьями.
У моховидных наоборот - коробочка без хлорофилла, гаметофит - зеленое растение с побегом. Плауны более высоко организованы, чем мхи.