Имеется сложная система отдельных мышц, которые крепятся к кутикуле изнутри, это позволяет совершать точные движения.
Пищеварительная система: передняя, средняя, задняя кишка, имеются пищеварительные железы.
Кровеносная система незамкнутая, сердечная трубка находится на спинной стороне. Миксоцель заполнен гемолимфой.
Дышат жабрами, легкими либо трахеями, мелкие представители – всей поверхностью тела.
Выделительная система – метанефридии, находятся в переднем конце тела. У пауков и насекомых дополнительно имеются мальпигиевы сосуды.
Нервная система: надглоточный ганглий (головной мозг) и подглоточный ганглий соединяются в окологлоточное нервное кольцо, от подглоточного ганглия отходит брюшная нервная цепочка, от ганглиев отходят нервы. Органы чувств хорошо развиты.
Членистоногие обычно раздельнополы и размножаются только половым путем.