Стінка травного каналу складається з чотирьох основних оболонок слизової, підслизової основи, м'язової та серозної оболонок. Рельєф, поверхня слизової оболонки травної трубки може бути гладкою (внутрішня частина губи і щоки), утворювати складки (стравохід, шлунок, кишка), поглиблення (ямочки - в шлунку, крипти - в кишці), вирости (ворсинки у тонкій кишці). Слизова оболонка складається з трьох платівок: епітеліальної, власної пластинки слизової оболонки і м'язової пластинки слизової оболонки. Тип епітелію слизової оболонки варіює залежно від функції відділу. У передньому і задньому відділах епітелій багатошаровий плоский, тому що тут він виконує переважно захисну роль, а в середньому відділі епітелій одношаровий циліндричний. Залози можуть бути розташовані в епітеліальної вистилки (ендоепітеліально), наприклад, келихоподібних клітини, у власній пластинці слизової оболонки, в підслизовій основі, або за межами травного каналу (великі слинні залози, печінка, підшлункова залоза). Власна пластинка слизової оболонки розташовується під епітелієм і складається з пухкої волокнистої сполучної тканини з кровоносними і лімфатичними судинами, нервовими елементами і лімфатичними скупченнями. У стравоході і шлунку в ній розташовані прості залози. М'язова пластинка слизової оболонки формир у ється з 1-3 сло е в гладком'язових клітин, розташованих, як правило, у внутрішньому шарі циркулярно, а в зовнішньому подовжньо. Підслизова основа з'єднує слизову оболонку з м'язовою оболонкою і складається з пухкої волокнистої сполучної тканини, що містить сплетення великих кровоносних судин, подслизистое (мейснерово) нервове сплетіння. У стравоході і 12-палої кишки в цій оболонці розташовані складні залози. М'язова оболонка зазвичай представлена двома шарами в стінці стравоходу і кишечника (внутрішніх-циркулярним, зовнішнім-подовжнім), а в шлунку трьома шарами м'язової тканини. У передньому і задньому відділах м'язова тканина переважно поперечно-смугаста, а в середньому - гладка. Між шарами м'язової тканини знаходяться прошарки сполучної тканини з кровоносними і лімфатичними судинами і міжм'язові (ауербаховому) нервовим сплетінням. Серозна оболонка складається з сполучно-тканинної платівки з судинами і нервовими елементами і з мезотелия, лежачого зовні. У деяких відділах (велика частина стравоходу, частина прямої кишки) серозна оболонка відсутня, і травний канал до цих відділах покритий адвентіціальной оболонкою складається з пухкої волокнистої сполучної тканини з судинами і нервовими структурами.