На территории современной Чехии образовалось государство Великая Моравия, которое включало в себя территории Словакии, Богемии, а также отдельные районы Польши и Венгрии. Первым правителем империи в начале IX в. стал Моймир I.
Следующий правитель Великой Моравии Ростислав (846—870) пригласил двух миссионеров Кирилла и Мефодия. Благодаря трудам легендарных братьев Византия вскоре предоставила моравянам привилегию богослужения на старославянском языке и использования глаголического письма, разработанного Кириллом. Старославянский язык стал третьим мировым языком в Европе, наряду с латинским и греческим.
В XI—XII вв. Чехия переживает период феодальной раздробленности.
В XIII в. у правящей династии Пршемысловцев сложилась чрезвычайно благоприятная политическая ситуация для восстановления своей государственной независимости. В 1212 г. Пршемысл I (1198—1230) получил Золотую буллу, в соответствии с которой Чешское княжество становилось самостоятельным и приобретало статус королевства.
В конце XIII — начале XIV в. чешские короли Пршесмысл II (1253— 1278) и Вацлав II (1278—1305) вели активную завоевательную политику.
В XIV в. чешская корона перешла к династии Люксембургов; ее первым представителем на чешском троне 1310г. стал Иоанн I. Рожденный в германских землях и получивший образование во Франции, новый король большую часть времени проводил в заграничных походах, не уделяя должного внимания своему королевству. Он погиб в битве при Креси в 1346 г.
Во время правления Карла VI (1346—1378) страна пережила свой золотой век. Главной целью нового короля было укрепление силы и мощи чешского государства. В 1346 г. Карл стал императором Священной Римской империи. Вскоре столица этого могущественного государства по его приказу была перенесена в Прагу. Чешский язык был приравнен к официальным в то время латинскому и немецкому, и в 1348 г. в городе был открыт университет.
Во время правления сына Карла, короля Вацлава IV, Чехия вступает в эпоху Реформации. Лидером нового религиозного движения стал Ян Гус — ректор Пражского университета, в котором он преподавал теологию. В 1401 г. он начал читать проповеди в Вифлеемской церкви в Праге, где в отличии от большинства других церквей мессы проходили не на латинском, а на чешском языке. В своих речах Гус осуждал чрезмерное богатство католической церкви, призывал к уравнению прав мирян и духовенства, а так же оспаривал некоторые теологические постулаты. В 1408 г. Гус был изгнан из университета, но продолжал публично отстаивать правоту своих убеждений. В 1414г. Гус был обвинен в ереси и приговорен к смертной казни: его сожгли 6 июля 1415 г. на Староместской площади в Праге. В стране начались массовые волнения, не утихавшие в течение многих лет. В 1419 г. приверженцы учения Гуса ворвались в здание городской ратуши и выбросили из окна на копья стоящей внизу толпы нескольких католических должностных лиц. Император Священной Римской империи Сигизмунд 1(1419—1437) с благословения папы возглавил крестовый поход против гуситов, которые отказались признать его на троне Чехии. Среди оппозиционных к королевской и папской власти сил, выступавших совместно на первых этапах гуситских войн, не было единства. Последняя битва гуситских войн произошла в 1434 г. при Лианах, когда император Сигизмунд I одержал окончательную победу над повстанцами.
Время правления Рудольфа II (1576—1611) считается в истории Чехии вторым Золотым веком. Столица Великой Римской империи была вновь перенесена в Прагу. В стране была провозглашена веротерпимость, за которой последовал экономический подъем.
Во время правления Марии-Терезии (1740—1780), в стране началась эпоха Просвещения. Сын императрицы Иосиф II (1780— 1890) провел в стране ряд серьезных реформ. В 1781 г. он выпустил эдикт о веротерпимости, положивший конец монополии католицизма, продолжавшейся в течении почти 150 лет. Также император в 1791 г. предоставил крестьянам личную свободу от феодалов.