Ну, самое простое: Gl ⇒Gl-6P — первая реакция гликолиза. Фосфокиназа будет действовать только на D изомер рацемата.
Чуть сложнее: любая изомераза (взять тот же гликолиз: ФГА ⇔ ФДА) действует только на, опять же, D- изомеры.
Совсем "сложно" (но близко мне): L-глутаминсинтетаза (NH₄⁺ лигаза) работает только с L (но никак не D) глутаматом.
И таких примеров куча...