Подводимая к кипящей жидкости энергия тратится на разрушение молекулярных связей и переходит во внутреннюю энергию пара. То есть эта энергия расходуется на увеличение внутренней (причем потенциальной, а не кинетической) энергии. Молекулы получая энергию, увеличивают расстояния между собой (и характер движения тоже) - жидкость превращается в газ.