Безусловные инстинкты - это у нас с рождения, заложено природой.
А вот рассудок, условные рефлексы - это то, что мы приобритаем.
А в подсознании остаются потому что мы тренируем и практикуем уловные рефлексы и со временем ты уже не задумываешься, когда выполняешь какое л. действие.