Пищеварительная система начинается ротовым отверстием, c одинаковыми зубами.
Глотка переходит в узкий пищевод, далее в мускулистый желудок и кишечник.
На границе между тонкой и толстой кишкой находится слепая кишка. Большая печень рептилий имеет желчный пузырь. Поджелудочная железа в виде длинного плотного тела лежит в петле двенадцатиперстной кишки. Кишечник заканчивается клоакой.