1)В период правления Бориса Годунова в стране был хаос, народ верил, что это происходит, потому что на престол взошел человек не из династии царей. Романов был родственником Рюриковичей.
2) Посадив 16-летнего Михаила, бояре хотели править через него, т.к. он оказался практически сиротой(отец его, патриарх Филарет был сослан в монастырь еще Борисом Годуновым)
Возможно есть еще причины