Помогите разобрать слово по составу Крылышками и ышк может быть корнем?

-ами - окончание, крылышк- - основа, крыл- - корень, -ышк- - суффикс.
Конечно, не может: "крылышки" образовано от "крылья", поэтому корнем может быть только -крыл-.