Из-за недостатка солнечного света бактерии активно росли и размножались внутри каждого зернышка. Питались органическими веществами, которые составляют зерно, т.к эти бактерии - паразиты. Температура поднималась при самой активной жизнедеятельности бактерий (они выделяют тепловую энергию). Черное вещество - остатки от жизни паразитов, переработанные вещества и сами отмершие бактерии.