Косвенные падежи - это все, кроме именительного. Т.е. родительный, дательный, винительный, творительный, предложный.
кого? чего? - родительный падеж.
где, куда, откуда, как, когда, зачем, почему - это вопросы наречия.
Вы неправильно ставите вопросы.
Есть вопросы, которые определяют части речи (т.е. сущ., гл., мест., наречие и т.д.)
а есть вопросы, которые определяют члены предложения (что делает? - глагол, кто - сущ., какой - определение, где, куда, зачем - обстоятельство и т.д.