Модернизация регулирования развития сельского хозяйства неразрывно связана с проблемами экономики в целом. Оказание некоторых видов поддержки ведет к косвенному воздействию на другие отрасли и не всегда это влияние оказывается позитивным. В связи с этим при разработке механизмов государственной поддержки необходимо применять комплексный подход. Некоторые меры реагирования на проблемы сельского хозяйства России и малого предпринимательства в агропродовольственном комплексе действенные применительно к отдельной отрасли, вызывают сомнение в их полезности в масштабах экономики в средне и долгосрочной перспективе.