В Краснодарском крае официально зарегистрировано свыше 700 религиозных организаций по 28 направлениям. Среди представителей разных религий в Краснодарском крае больше всего православных христиан (РПЦ).
Второе место по количеству прихожан принадлежит протестантским организациям. Их в крае насчитывается более 200. Сюда входят: свидетели Иеговы, евангельские христиане-баптисты, христиане веры евангельской (пятидесятники), адвентисты седьмого дня, евангельские христиане и другие.
В Краснодарском крае действуют 13 приходов Армянской апостольской церкви, 11 приходов Римско-католической церкви и 12 мусульманских религиозных организаций, а также другие немногочисленные организации.