Всі структурні гени транскрибують РНК - іРНК, рРНК, тРНК. У прокаріотів структурні гени організовані у вигляді незалежних генів, транскрипційних одиниць і оперонів. Незалежні
гени складаються з безперервної послідовності кодонів, вони постійно
експресують і не регулюються на рівні транскрипції. Транскрипційні
одиниці - групи різних генів, які пов'язані функціонально і
транскрибуються одночасно, що забезпечує у подальшому однакову кількість
синтезованих продуктів. Зазвичай це гени білків або нуклеїнових кислот (у кишкової палички у
складі одного з транскріптонів знаходяться два гена т-РНК, три гена
р-РНК).
Структурні гени мають загальний промотор, оператор і термінатор,
беруть участь в одному метаболічному циклі і регулюються координовано. У еукаріотів структурні гени, функція яких пов'язана з регуляторними генами, утворені у вигляді незалежних генів, повторюваних генів і кластерів
генів.
Незалежні гени, як правило, розташовуються індивідуально, їх транскрипція не пов'язана з транскрипцією інших генів. Активність деяких з них регулюється гормонами.