Простейшие участвуют в образовании осадочных пород. Это возможно, если скелеты состоят из нерастворимых веществ и не являются слишком хрупкими. Известковые раковинки фораминифер после смерти простейших остаются на дне и с годами накапливаются, образуя известняк. Например, нуммулиты образовали нуммулитовый известняк, из которого построены некоторые пирамиды в Египте. Скелеты радиолярий, состоящие из кремнезёма, тоже образуют осадочные породы. После уплотнения и некоторых превращений такие осадки становятся твёрдыми и превращаются в опалы и яшмы.