Все запятые расставлены:
1) Хотя небо уже потемнело, облака всё ещё различались на нём.
2) Петька поднял голову и увидел картину, о которой много говорили последнее время.
3) Мы решили идти через час, если дождь перестанет моросить.
4) Надо было торопиться, так как начинало светать.
5) Тёмная поверхность моря ждёт первого луча, чтобы заиграть весёлым блеском.
6) Когда садится солнце, в лесу становится всё тише и тише.
7) Командир предполагал, что отряд скоро выйдет к морю.
8) Я отвечал замечательно, так что оценка должна быть высокая.
9) Щенок скулил так жалобно, будто плакал ребёнок.
10) Он так близко подошёл к окну, что ему стали видны люди, находившиеся в комнате.
11) Там куда ещё не проникли солнечные лучи, деревья утопали в синей дымке.