Фильм получил как положительные, так и отрицательные отзывы российских кинокритиков. Большинство обозревателей отметили сходства некоторых ключевых компонентов фильма с аналогиями в фильмах цикла «Властелин колец» (в частности, башня Каменной Княжны сравнивается с Ортханком, а ардары — с назгулами). Упоминая творчество советского режиссёра-сказочника Александра Роу, критики считают, что «Книга мастеров» значительно уступает ему. Каменная Княжна часто сравнивается с Хозяйкой Медной горы Бажова.
Положительно обозреватели отозвались о визуальных эффектах, используемых в фильме. Рецензент от «РусКино» отмечает, что «спецэффекты хороши, но до уровня голливудских блокбастеров им, конечно, далеко»[9]. Критик от «ProfiCinema» считает, что спецэффекты не уступают по качеству голливудским[10]. Обозреватель от ресурса «World Art» отмечает «красивые визуальные эффекты, зримо и впечатляюще рисующие могущество Каменной Княжны, которые придают действу налёт искусственности, на грани трёхмерной компьютерной анимации»[11]. Менее позитивной оценки удостоился грим актёров: многие рецензенты считают, что его было использовано слишком много, в особенности, для главного героя, сыгранного Максимом Локтионовым[9][12][13][14].
Различных отзывов удостоилась игра актёров. Обозреватель от «РусКино» положительно оценивает работу всех актёров, описывая её как «настоящий мастер-класс того, как нужно играть в лентах для детей и комедиях». По его мнению, «актеры среднего и младшего поколения не отстают от ветеранов»[9]. Критик от «World-Art» называет образы «старых» актёров колоритными, но отмечает менее хорошую работу остальных актёров[11]. Ресурс «Новости кино» оценивает актёрскую игру молодёжи негативно: по мнению критика, «Иванушка, Катя и Кузьма выглядят в кадре деревянными, Каменная княжна — каменной, а барская дочь Клава — резиновой»[15]. «NewsLab» называет работу актёров-дебютантов, взятых на две главные роли, отличной, а их самих — красочными и талантливыми; такое же мнение высказывается и об опытных актёрах[16]. Рецензент от «Filmz.ru» негативно оценивает игру всего актёрского состава, считая её неправдоподобной[14]. Обозревателями от «Интересное кино», «Новости кино» и «Газета.ру» было особенно тепло встречено участие в картине Михаила Ефремова[17][15][12].
Сюжет фильма был раскритикован большинством обозревателей. Он описывается как путанный, фрагментарный и ограниченный. Негативные отзывы получило и осовременивание народных сказок, использованное в фильме. Обозреватель сайта «Газета.ру» описал историю как «аляповатое буриме из Толкиена и русского фольклора, в котором героям второго откровенно тесно и некомфортно»[12]. По словам обозревателя от сайта «SQD.ru», «все сказочное действо втиснуто в три локации, между которыми мечутся всенародно любимые актеры и начинающая театральная молодежь»; по его мнению, «осовременивание и отсебятина делают историю совсем уж камерной и абсурдной»[18]. Критик от Filmz.ru считает, что сюжет представляет собой «лубочную бессвязную компиляцию из канонических ситуаций и примитивных гэгов»[14]. Обозреватель от «Новости кино» сравнивает сюжет с компьютерным квестом[15]. Положительно сюжет оценили рецензенты от «РусКино» и «NewsLab», назвав его увлекательным, продуманным и богатым, однако и они отмечают наличие недочётов: это неточности в сюжете, вызванные, по словам обозревателя от «РусКино», плохим представлением автора сценария о жизни холопов тех времён; по мнению критика от «NewsLab», «из-за стремления впихнуть в эту основу всего и побольше у „Книги мастеров“ регулярно начинаются странные вихляния интонации», также обозреватель посчитал, что без некоторых действующих лиц можно было обойтись[9][16].
Некоторые обозреватели высказали мнения насчёт факта продюсирования данного фильма кинокомпанией Walt Disney Pictures. По их мнению, от фильма этой компании следовало ожидать большее, чем в итоге получилось. Рецензент от «NewsLab» назвал факт съёмки данного российского фильма данной американской компанией оксюмороном и «новой экономической реальностью». По его мнению, «первый блин у компании „Дисней“ на русской почве хоть и вышел несколько комом, но почему-то не хочется, чтобы он оказался последним»[16]. Рецензент от «World Art» положительно отметил факт привлечения студией местных актёров вместо задействования собственных кадровых резервов, что свидетельствует об уважении западных продюсеров к русской культуре[11]. Обозреватель от сайта «SQD.ru» высказал удивление тем, что продюсирование Disney не помогло сделать хороший фильм, несмотря на то, что западным производителям известен секрет успешного детского кино[18]. По мнению «Filmz.ru», кино как таковое не состоялось, продюсеров Walt Disney Pictures волновал лишь рынок, а отечественных производителей — освоение бюджета[14].