При Юстиниане Византия была христианской. Но стоит отметить, что в христианской церкви на тот момент существовали отдельные течения: диофизиты (прообраз православия) и монофизисты (популярны в Сирии и Египте), между которыми шли постоянные теологические и не только споры и столкновения. В империи еще оставалось язычество, для его искоренения была создана философская школа в Афинах.