Ошибка в данных предложениях в том, что причастный оборот стоит не в том месте из-за этого изменяется смысл(становится неверным).
1)Машинист впервые в своей жизни вёл электровоз, окончивший недавно курсы - Машинист, окончивший недавно курсы, впервые в своей жизни вёл электровоз
2)Дедушка присел на пенёк, собиравший грибы - Дедушка, собиравший грибы, присел на пенёк.
3)Пастух увидел наш костёр, заночевавший в горах - Пастух, заночевавший в горах, увидел наш костёр.
4)Самолёт сел на аэродром, вылетевший из Москвы - Самолёт, вылетевший из Москвы, сел на аэродром.
5)На целинные просторы вышли тракторы, густо заросшие травой - На целинные просторы, густо заросшие травой, вышли тракторы
Чёрным цветом выделены причастные обороты.