Фосфорная кислота участвует в образовании нуклеиновых кислот. Нуклеиновые кислоты представляют собой генетический материал всех живых организмов.
В образовании молекулы нуклеотида - элементарного звена нуклеиновой кислоты участвуют сахар, азотистое основание и фосфорная кислота. Сначала, в результате объединения сахара и азотистого основания образуется нуклеозид. Реакция идет в выделением молекулы воды (реакция конденсации). Для образования нуклеотида нуклеозид реагирует с фосфорной кислотой с образованием фосфоэфирной связи. Это вторая реакция конденсации.
Нуклеотиды, содержащие остатки фосфорной кислоты, так же входят в состав многих коферментов, например, аденозинмонофосфата, аденозиндифосфата, аденозинтрифосфата и др.