Кукушкин лен относится к зеленым мхам. Высотой приблизительно 20 см. Стебли буровато-зеленые, неветвящиеся, густо покрыты узкими листьями. Корней нет, есть ризоиды- нитевидные выросты из одной или нескольких клеток. У него есть ткани- покровная и проводящая, но более простого строения, чем ткани цветковых растений.