Эта поговорка не обязательно русского происхождения, напр. она с 17 века известна в Англии. Есть несколько толкований происхождения. Наиболее основательные доводы приводятся в пользу бюджетной версии, где речь идёт всего о двух "концах", соотв. английскому варианту. Речь идёт о сходимости конечных записей доходов и расходов (например, в конце года).