Правильно сказать: глас (голос) вопиющего(вопящего, кричащего) в пустыне.
В пустыне никого нет. Кричи- не кричи - не докричишься.
Например в таком тексте: Все ребята шумели на уроке и не слушали учителя, поэтому его голос был гласом вопиющего в пустыне.